醫療稅務｜自費醫療／醫美合規
自費醫療服務 列查稅重點與合規攻略
自費醫療（含醫美）市場擴張，查核同步升級。「醫療免稅」與「醫美應稅」如何判斷？哪些資料最容易被要求？本頁用白話圖表＋實務清單，幫你快速對焦。
醫療免稅 vs 醫美應稅：實務判斷表
| 判斷面向 | 免稅醫療（多屬營業稅免稅） | 應稅醫美/自費服務（多需課 5% 營業稅） |
|---|---|---|
| 目的與必要性 | 以疾病診療、功能修復為目的，具醫療必要性並有診斷基礎。 | 以外觀/美觀改善為主要目的，難證明醫療必要性。 |
| 執行主體 | 合法醫療人員於合格醫療機構執行；有病歷與醫囑。 | 美容/醫美專案、療程包次、保養課程等；多以價目表/合約銷售。 |
| 文件證據 | 病歷、檢查報告、處置紀錄、健保或保險給付紀錄。 | 療程契約、價目表、行銷文案、前後對照影像；若無病歷多被認定應稅。 |
| 開立憑證 | 可開立收據（免稅範圍），依規定保存。 | 原則應開立統一發票（或電子發票）；未開立屬查核重點。 |
實務以「目的/必要性＋文件證據」綜合判斷。遇到邊界情形，務必保留醫療評估與會診意見備查。
常見查核線索（容易被點名檢視的跡象）
- 院所報繳營收偏低，與地區同業或刷卡/第三方金流明細不相當。
- 大量現金交易、退款/沖帳頻繁、虛列支出或對外勞務費比例異常。
- 銷售療程包次、儲值款，認列時點不清；未區分預收/收入與已耗用。
- 醫師與院所分潤之帳務與憑證不完整，人事或委外費與實際時數/病例不符。
- 社群/網站廣告明顯為醫美/美容宣傳，但帳上列作醫療免稅收入。
帳簿與憑證：被要求提供時，最好一拿就齊
交易／收入類
- 價目表、專案（包次/儲值）契約與條款、活動 DM。
- 掛號/預約/到診名單，療程明細與病歷/處置紀錄（連結醫乃可證免稅）。
- 收款明細：現金、刷卡、第三方金流；退款/折讓與簽核。
- 預收款、應收帳款、已耗用/剩餘堂數之對帳表。
- 統一發票或收據（免稅）、作廢/折讓證明。
成本／費用／分潤
- 醫材與藥品進銷存、耗用簽收、衛管紀錄。
- 醫師/護理師/技師分潤或時薪之合約、派工紀錄、排班與簽到。
- 員工獎金、代班費、KOL 合作、行銷投放與報表。
- 租金、設備折舊、維修校正、保固合約等。
建議：將「預收款」與「收入」分帳管理；療程耗用以系統化結轉。所有金流（含第三方）須能對帳到發票/收據與病歷。
5 分鐘自檢（快速掃雷）
01｜服務分類
是否明確區分「醫療免稅」與「醫美應稅」？每筆都能以文件證明。
是否明確區分「醫療免稅」與「醫美應稅」？每筆都能以文件證明。
02｜開立憑證
應稅項目是否確實開立統一發票（含電子發票）？退費有折讓單？
應稅項目是否確實開立統一發票（含電子發票）？退費有折讓單？
03｜包次/預收
預收→收入的結轉規則清楚？可追溯每位客戶的剩餘堂數與耗用。
預收→收入的結轉規則清楚？可追溯每位客戶的剩餘堂數與耗用。
04｜分潤合約
醫師/人員之分潤、委外是否有合約與佐證？與實際時數一致？
醫師/人員之分潤、委外是否有合約與佐證？與實際時數一致？
05｜金流對帳
現金、刷卡、第三方金流均能對到發票/收據與病歷/處置。
現金、刷卡、第三方金流均能對到發票/收據與病歷/處置。
06｜留存年限
帳簿憑證、病歷與醫材紀錄，是否依規定年限妥善保存與備份。
帳簿憑證、病歷與醫材紀錄，是否依規定年限妥善保存與備份。
補救與緩解：若已落差，怎麼做比較好？
- 內部盤點：先自檢 12–36 個月的收入/金流/病歷/發票一致性，整理差異清單。
- 與承辦溝通：釐清歸類與事證；邊界案以醫療必要性＋診療紀錄佐證。
- 自動補報補繳：依稅捐稽徵法相關規定，自行申請補報補繳及利息，通常可降低裁罰風險。
- 制度化改善：導入電子發票、預收/耗用結轉模組、金流對帳、簽核與檔案留存 SOP。
提醒：各地國稅局實務口徑可能略有差異；以承辦機關書面或會議結論為準。
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免責聲明：本頁為教育性整理，非稅務或法律意見；實務仍以主管機關公告、個案書面核定與合約文件為準。
法規依據與延伸閱讀（中文）
- 營業稅與發票： 財政部稅務入口網（營業稅常見問答）、 電子發票專區、 統一發票規範（法規資料庫檢索） 。
- 醫療服務免稅範圍： 臺北國稅局、 北區國稅局、 中區國稅局、 南區國稅局、 高雄國稅局 （各局醫療服務免稅宣導/說明頁）。
- 稅捐稽徵法： 稅捐稽徵法（全條文） －補稅補繳與裁量原則（自動補報補繳多可減輕處罰）。
- 醫療法、醫療機構管理辦法／病歷保存與醫材管理： 醫療法（全條文）、 法規資料庫（搜尋：醫療機構管理、病歷保存） 。
- 更多： 財政部稅務入口網（etax）、 臺北國稅局、 北區國稅局、 中區國稅局、 南區國稅局、 高雄國稅局、 法務部全國法規資料庫 。